我國的股份合作制與傳統(tǒng)意義上的股份制和合作制有著本質(zhì)的區(qū)別。我國合作制企業(yè)的股權(quán)結(jié)構(gòu)是由企業(yè)內(nèi)部職工出資構(gòu)成，其企業(yè)資金制度是封閉的；股份公司的股權(quán)結(jié)構(gòu)是由自然人和法人出資構(gòu)成，沒有出資人在企業(yè)內(nèi)部或是外部的限定，沒有規(guī)定控股的產(chǎn)權(quán)主體，沒有股權(quán)轉(zhuǎn)讓的限制條件，其企業(yè)資金制度是全開放的。但是合作制企業(yè)的投資股者是特定對(duì)象，主要由大多數(shù)職工人股，由職工共同出資，不吸納企外部的自然人和法人投資人股，不以股份形式向社會(huì)籌集資金，這與一公司制企業(yè)通過向社會(huì)公開發(fā)行股票，向社會(huì)非特定對(duì)象發(fā)行股票籌資金的做法有著根本的不同。
我國股份合作制企業(yè)要求51%以上的職工持股，強(qiáng)調(diào)以職工為主，堅(jiān)持了合作制的基本原則，但又靈活采用股份制的形式引入企業(yè)外部出資人做股東，這種企業(yè)產(chǎn)權(quán)主體的設(shè)置是建立勞動(dòng)與資本共享利益制度的前提。
股份合作制這種職工控股的產(chǎn)權(quán)結(jié)構(gòu)決定了它是一種勞動(dòng)者權(quán)益與本所有者權(quán)益相互融合、共享利益的企業(yè)制度。產(chǎn)權(quán)主體是企業(yè)內(nèi)者與企業(yè)外資本所有者的組合，既保證了職工的地位和根本利益以及工對(duì)企業(yè)經(jīng)營者的選擇、重大經(jīng)營決策、內(nèi)部分配形式等方面的權(quán)利，靈活的按股分紅與按勞分配相結(jié)合的分配形式，形成勞動(dòng)力資本差異股權(quán)化的激勵(lì)制約機(jī)制，有利于企業(yè)資源的合理配置。